明朝建立以后，道教承宋元旧制，分为正一、全真两大派系，官方发给不同的度牒。明朝皇室因鉴于世居龙虎山张陵后裔在道教中的影响，一方面肯定了元代授正一道教主的地位，但又革除“天师”称号，改授为正一嗣教真人。

在明代皇帝中，特别崇奉道教的明世宗（朱厚熜1522—1566年在位），他自号“玄都境万寿帝君”，躬亲礼斋，许多道事士被授予“少保”、“礼部尚书”等官衔，参与朝政。

明代历世还在京师设置道箓司，在各府设置道正司，在各县设置道会司，将道教事务列入朝廷行政管理的范围。

明朝正一道的政治地位居道教各派之首。早在1361年朱元璋攻占南昌时，正一道第42代天师张正常就曾谴使拜谒，密告“符命”，与朱氏接上关系。

明朝开国后，张正常于洪武元年（1368年）入朝礼贺，明太祖封他为正一嗣教真人，赐银印，秩视二品。

洪武五年，又敕令张氏永掌天下道教事。从此正一天师便上升为道教各派首领，其地位较元代正一天师统领江南道教更高。

张正常以擅长符水治病术闻名，羽化于洪武十年（1377年）。其子张宇初嗣位后，袭封正一嗣教大真人，领道教事。

此后明朝历代天师皆沿例袭封大真人，掌管天下道教。张宇初博学能文，撰有《道门十规》。该书吸收全真道性命双修及严守清规戒律之宗旨，指出道士应遵守的10条戒律，以之推广于道教各派，意图整顿道教。

他还撰有诗文集《岘泉集》，对道教思想宗旨及修持方法多所发挥，堪称宋元以来最有学识的正一天师。张宇初还曾奉敕设醮建斋，重建龙虎山上清宫。

明太祖认为禅宗与全真道“以修身养性，独为自己而习”，无助于伦理教化，故重视正一而贬抑全真。

因此全真道在明代政治地位下降，教团发展受限制，其势力远不及金元时代。

全真道自元代以来，七真门下各自开派，形成7个支派。其中丘处机所开龙门派势力最强。该派传至明代，出现以戒律密传的“龙门律宗”。

此宗以丘处机门人赵道坚为第一代律师，赵传张德纯，张传陈通微，陈传周玄朴。周玄朴是龙门第四代律师，受法于洪武丁卯（1387年）。周玄朴后传于张静定、沈静圆，龙门律宗此后分作张、沈二支流衍。

明世宗时，有龙门第4代弟子孙玄清（1517——1569年），得山东崂山李显陀、铁查山通源子及斗篷张真人之传，颇有道术。

嘉靖三十七年（1558年）至京师白云观坐钵修炼，祈雨有验，诏赐“紫阳真人”之号。孙玄清门下形成“金山派”，亦称崂山派，属龙门支派。

明代著名的道士还有张三丰、邵元节、陆西星等。其中最为有名的道士是张三丰。其人生卒年代不详，曾在湖北武当山（一名太和山）修道，后离武当山隐居。

太祖、成祖均曾谴使寻觅，不遇，乃营修武当宫观。道教从而有南派之武当道，据《诸真宗派总簿》载，武当道派有自然派、三丰派等传衍近代。明英宗天顺三年（1459年），张三丰被封为“通微显化真人”。

邵元节（1459——1539），字仲康，号雪崖，江西贵溪（一说安仁，即今江西余江）人。 居龙虎山上清宫。师事范文泰、李伯芳、黄太初。

不应宁王朱宸濠之召，放浪形骸于江湖间。明世宗嘉靖三年（1524）征之入京，召对便殿，颇得世宗赏识，达十五年之久。

邵元节虽位极人臣，但他谨小慎微，很少干预朝政，专心祷祀。著有《太和文集》。

陆西星（1520——1606）为明代内丹东派开创者。字长庚，号潜虚子。扬州兴化（今属江苏）人。擅文词，兼工书画。因屡试不中，乃弃儒入道，入山隐居。自称得吕洞宾真传，著书立说，阐发内丹之旨，遂开内丹东派，被后世道士尊为内丹东派之祖。

著有《方壶外史》八卷，包括经典注释及丹法十五种，《南华附墨》八卷。近现代一些学者考证，著名神怪小说《封神演义》的原作者实为陆西星。

在明代，还可以值得一提的是明永乐四年（1406年）成祖敕令第四十三代天师张宇初纂修《道藏》。正统九年（1444年）英宗继承成祖之志，诏通妙真人邵以正督校《道藏》，次年（1445年）编成《正统道藏》5305年卷，凡480函。

至万历三十五年（1607年），第五十代天师张国祥奉命续补《道藏》，凡32函，180卷，名《万历续道藏》。与《正统道藏》合计共5485卷，512函，即现存之明版《道藏》。成为道教史上现存最完备和最重要的经籍总集。